1、級別不一樣
資訊系統管理師在軟考級別中屬於“高階”，而系統整合專案管理師在考級別中屬於“中級”。
2、考試科目不一樣
資訊系統專案管理師考試科目包括《資訊系統專案管理綜合知識》、《資訊系統專案管理案例分析》和《資訊系統專案管理論文》，系統整合專案管理師考試科目包括《系統整合專案管理基礎知識》、《系統整合專案管理應用技術（案例分析）》。
3、考試難度不一樣
資訊系統管理師考試科目多了論文，考試難度比系統整合專案管理師大一些。
總結：
資訊系統管理師和系統整合專案管理師在級別、考試科目、考試難度等方面有所區別。
