1、吃生雞蛋易患傳染性疾病；大約10%的鮮蛋裡含有致病的沙門氏菌、黴菌或寄生蟲卵. 如果雞蛋不新鮮，帶菌率就更高. 細菌可以從母雞卵巢直接進入雞蛋，也可以在下蛋時由肛門裡的細菌汙染到蛋殼上，再經蛋殼上的氣孔進入雞蛋。這些細菌都怕高溫，煮沸8min～10min，蛋殼內外的細菌就會被殺滅。
2、生雞蛋中的蛋白質不易消化；生雞蛋中有抑制胃蛋白酶活性和腸蛋白酶活性的抗胰蛋白酶，使雞蛋中的大量蛋白質無法被人體消化吸收。不被吸收的蛋白質在體內可產生很多有害物。抗胰蛋白酶受熱會失去活性，因此煮熟雞蛋有利於營養物質的消化吸收。
3、生雞蛋導致生物素缺失；生雞蛋中含有一種蛋白，可以和人體生物素髮生反應，生成難以被人體消化的物質，導致人體生物素缺失。生物素不足可影響人體對其他營養物質進行消化，引起消化不良和營養物質缺乏。熟雞蛋中這種蛋白質變性，所以日常生活中最好不食用生雞蛋。
