拼多多店鋪分爲個人店鋪和企業店鋪，其中個人店鋪分爲個人身份店鋪和個體工商戶身份店鋪。企業店鋪則分爲賣場型旗艦店，專賣店，專營店，這三種店鋪類型的保證金都是50000元，在企業店鋪當中還有一種旗艦店，跟賣場型旗艦店不同，這種旗艦店的保證金是1000元。
不繳納押金的話會受到如下限制：
禁止使用貨款提現功能。
禁止使用商品發佈，銷售等店鋪功能。
禁止參加平臺營銷活動，競價活動。
禁止使用店鋪推廣功能，推廣店鋪銷售的商品。
拼多多針對不同類目，也設定了不同額度的保證金。比如大家電（熱水袋，熱水器，油煙機，煤氣竈，集成竈，烤箱，蒸箱，微波爐）等等廚房大電保證金爲50000元。而作爲每年季節性熱門產品大閘蟹則需要繳納100000元保證金。
