1、特点不同
2、命名不同
3、组成不同
特点不同：有机化合物种类繁多、数目庞大（已知有3000多万种、且还在以每年数百万种的速度增加）。但组成元素少，有C、H、O、N 、P、 S、 X（卤素：F、Cl、Br、I ）等。无机物有很多不含碳元素，成键方式较有机物更为复杂。
2.命名不同：无机化合物的命名，应力求简明而确切地表示出被命名物质的组成和结构。这就需要用元素、根或基的名称来表达该物质中的各个组分；用“化学介词”（起着连接名词的作用）来表达该物质中各组分的连接情况。“有机”这历史性名词，可追溯至19世纪，当时生机论者认为有机化合物只能以生物（life-force，vis vitalis ）合成。此理论基于有机物与“无机”的基本分别，无机物是不会被生命力合成而来。但后来这理论被推翻，1828年，德国化学家维勒（Friedrich Wohler）首次用无机物氰酸铵合成了有机物
3.组成不同：无机物指不含碳元素的纯净物以及部分含碳化合物，如一氧化碳、二氧化碳、碳酸、碳酸盐、碳化物、碳硼烷、烷基金属、羰基金属、金属的有机配体配合物等的集合。有机物狭义上的有机化合物主要是指由碳元素、氢元素组成，一定是含碳的化合物，但是不包括碳的氧化物和硫化物、碳酸、碳酸盐、氰化物、硫氰化物、氰酸盐、碳化物、碳硼烷、烷基金属、羰基金属、金属的有机配体配合物等物质。
