1、科属不同
鲫鱼是鲤科鲫属下的动物统称；鲤鱼为鲤属，别名鲤拐子、鲤子、毛子、红鱼。
2、外形不同
（1）鲫鱼的腹面为银灰色，体背面为青褐色，各鯺条均为灰白色，外形似鲤鱼，但身体更高，背鳍、臀鳍都具有硬刺，后缘呈锯齿形，跟鲤鱼最大的区别是须，鲤鱼嘴部有4根须，吻须一对，颌须比吻须长两倍。
（2）鲤鱼的体型稍大，两侧扁平，腹部圆润，头短小，吻钝且鳃耙长，鳃丝细长，背面为灰黑色，背鯺前稍微隆起，侧线下方为近于黄色、黑色，腹部为白色、背鯺微黑。
3、鱼唇不同
鲫鱼鱼唇单薄肉少，口旁无须；鲤鱼具两对须，三排咽喉齿。
4、分布范围不同
（1）鲫鱼在全国各地（除西部高原）广泛分布，是我国一种优良的养殖鱼类和经济鱼类，全国各地水域常年均有生产，栖息在河渠、沼泽、湖泊、江河中，尤以水草茂盛的浅水湖和池塘较多，是一种适应性很强的鱼类，繁殖能力极强。
（2）鲤鱼原产亚洲，后引入欧洲、北美及其他地区，分布在除澳洲和南美洲外的全世界。是淡水鱼类中品种最多、分布最广、产量最高、养殖历史最悠久者之一。单独或成小群地生活于平静且水草丛生的泥底的湖泊、池塘、河流中。
5、食性不同
成鱼鲫鱼主要以植物性食料为主。由于植物性饲料在水体中蕴藏丰富，品种繁多，供采食的面广；鲤鱼属于底栖杂食性鱼类，荤素兼食，饵谱广泛，吻骨发达，常拱泥摄食。
