1、时间期限不同：当年余额是当年一年所剩的余额，历年余额是几年累积所剩的余额。即当年余额就是当年充的费用所剩余额，历年余额是指由之前几年所剩余额积攒所剩余额。
2、使用范围不同：
当年账户里面的钱可以用来支付门诊、急诊、院前急救、定点零售药店购药的费用。
历年账户中的钱可以用来支付门诊、急诊（含院前急救）自负段的医疗费用以及附加基金支付后剩余部分的医疗费用。
历年账户金额的适用范围更广，凡是需要个人负担的部分、医保无法报销的部分都可以使用，但当年账户金额的使用范围就要窄了很多。
3、金额不同：历年账户的余额高于当年账户余额。
